در سال 1372، به منظور تحقق سیاست‌های کلان وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، ادغام سازمان‌های بهداری و بخش آموزش گروه‌های پزشکی و پیراپزشکی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی-درمانی کهگیلویه و بویراحمد به تصویب رسید. این ادغام به فعالیت‌هایی در جهت تربیت نیروهای متخصص در حوزه علوم پزشکی انجامید.
اقدامات ابتدایی شامل پذیرش و تربیت دانشجویان در رشته‌های کاردانی بهداشت محیط و بهداشت خانواده بود که تحت نظر دانشکده پزشکی و بعد از آن در آموزشکده پیراپزشکی (شامل رشته‌های بهداشت محیط، بهداشت عمومی، اتاق عمل و هوشبری) انجام می‌شد. از سال 1374، با تأسیس آموزشکده بهداشت، این مرکز آموزش مستقل نسبت به فعالیت در چهار گروه آموزشی (بهداشت محیط، آمار و اپیدمیولوژی، بهداشت عمومی و تغذیه) اقدام کرد. از سال 1376 نیز پذیرش دانشجو در رشته مبارزه با بیماری‌ها آغاز گردید.
به تدریج، در سال 1385، مقطع کارشناسی ناپیوسته بهداشت محیط راه‌اندازی شد. پس از آن، در سال 1387، کارشناسی پیوسته بهداشت محیط، کارشناسی بهداشت عمومی و کارشناسی تغذیه به دوره‌های آموزشی اضافه گردید. همچنین، کارشناسی ارشد آموزش بهداشت در سال 1390 و کارشناسی ارشد مهندسی بهداشت محیط در سال 1391 تأسیس شدند. در سال 1400 نیز پذیرش دانشجویان در مقطع کارشناسی مهندسی حرفه‌ای آغاز گردید و در ادامه، در سال 1401 رشته کارشناسی بهداشت مدارس به این برنامه‌های آموزشی افزوده شد.
